Het bestuur van de Dr. C. Louise Thijssen-Schoute Stichting wordt gevormd door:
- Prof.dr. W. van Bunge, voorzitter
- Dr. N. Geerdink, secretaris
- Mr. F.J. Schoute, penningmeester
- Prof.dr. N. Akkerman
- Prof.dr. E. Jorink
- Prof.dr. I. Leemans
- Prof.em.dr. Th. Verbeek
- Prof.dr. A. Visser
Het bestuur van de Stichting komt tweemaal jaarlijks bijeen, doorgaans in april en november. De bestuursleden van de Stichting genieten geen beloning voor hun werkzaamheden.